马来西亚位于东南亚，国土被南海分隔成东、西两部分，即马来半岛南部（西马）和加里曼丹岛北部（东马），全国面积共33万平方公里。
西马马来半岛约占全国陆地面积40%，沿海地区都是平原，中部则是布满茂密热带雨林的高原山地。其中蒂迪旺沙山脉是马来西亚半岛一些较大河流的源头，如彭亨河和吉兰丹河。
东马位于加里曼丹岛北部，分为沙捞越和沙巴两部分，克洛克山脉由沙捞越向北延伸，穿过沙巴中央。伊兰山脉是沙捞越和印度尼西亚的界山，沙捞越较大的河流如拉让江、巴兰河等均发源于此山。
受地形及气候影响，马来西亚的河流大多短小，但水量丰富。西马的河流均由中央高原山地向四周辐射流入太平洋的南中国海和印度洋的马六甲海峡。主要河流有：彭亨河、 霹雳河和吉兰丹河等。东马河流密布，具有通航价值。沙捞越的主要河流由东南向西北流， 注入南中国海；沙巴主要河流则由西向东流，注入苏禄海。主要河流有拉让江、基纳巴唐岸河和巴兰河等。
拉让江位于沙捞越州，是马来西亚第一大河，发源于伊兰山脉，注入南中国海。拉让江全长约563公里，流域面积4.43万平方公里，主要支流有巴鲁伊河、涅玛河、依兰河、庇拉河、巴莱河、布金河和卡诺维特河。
巴兰河是沙捞越州东部河流。源于州内地势最高、雨量最丰的东北部山区，先西南流，折向北流，在巴兰角注入南海。巴兰河全长401公里，流域面积2.21万平方公里。支流有巴孔河、阿波河、帕卢坦河和帕塔河等。
基纳巴唐岸河是沙巴州最大河流。源于西部威提岭，横贯本州的中部，东流注入苏禄海。全长560公里，流域面积1.68万平方公里，南岸支流瓜穆河瓦塞马约瀑布，高6米，宽60米，是沙巴水量最大的瀑布。主要支流库阿穆特和洛坎河同为沿海城市和森林地带的唯一交通途径。
彭亨河是马来半岛最长的河流，源于金马伦高原的蒂迪旺沙山脉，由哲莱河和淡美岭河汇合而成两河，以淡美岭河为主源，流经吉保山脉以东、大汉山以南、东海岸山脉以西，流域包括彭亨州和黑飞州，最终汇入南中国海。彭亨河全长459公里，流域面积2.93万平方公里。
霹雳河，霹雳州重要河流。源于泰国边境，自北而南纵贯全州，注入马六甲海峡。河长401公里，流域面积15151平方公里，其中马来西亚境内1.49万平方公里。
吉兰丹河是吉兰丹州最大河流。发源于马来西亚中部高原的蒂迪旺沙山脉，自南往北，纵贯全州，注入南海，长48公里，流域面积1.19万平方公里。
马来西亚的州与河同名很多，除了上面所说的吉兰丹州与吉兰丹河、霹雳州与霹雳河、彭亨州与彭亨河外，还有柔佛州与柔佛河（河长122公里，流域面积2636平方公里）、吉打州与吉打河、 丁加奴州与丁加奴河、马六甲州与马六甲河、雪兰莪州与雪兰莪河、沙捞越州与沙捞越河（河长121公里）等。
